জন্ম ১৯৪২ সালের ১০ এপ্রিল নাটোরে। একটি শিক্ষিত পরিবারের বলয়ে বেড়ে উঠেছেন তিনি। তার প্রয়াত পিতামহ দীর্ঘ ৩৩ বছর মহারাজা জগদিন্দ্রনাথ হাই স্কুলের প্রধান শিক্ষক এবং তিনি ছিলেন একজন গ্রাজুয়েট। শেখর সান্যাল রাজশাহী বিশ্ববিদ্যালয় থেকে আই কম ও এম কম উভয় পরীক্ষাই প্রথম স্থান লাভ করেন। ১৯৬৪ সাল থেকে তিনি শিক্ষকতা পেশায় জড়িয়ে পড়েন। ১৯৮৮ সালে লাভ করেন শ্রেষ্ঠ শিক্ষক হিসেবে জাতীয় পুরস্কার। এছাড়াও এযাবৎ তিনি অসংখ্য সম্মাননায় ভূষিত হয়েছেন। তিনি বেশ কয়েকটি দেশ ভ্রমণ করেছেন সেখান থেকে পেয়েছেন রঙিন অভিজ্ঞতা। ব্যক্তিজীবনে তিনি তিন পুত্র ও এক কন্যার পিতা। স্ত্রী সেবা সান্যাল একজন অবসরপ্রাপ্ত জেলা শিক্ষা অফিসার। পুত্র-কন্যা সবাই স্ব-স্ব ক্ষেত্রে প্রতিষ্ঠিত। ২০০০ সালে পাবনা সরকারি এডওয়ার্ড কলেজ থেকে তিনি অবসর গ্রহণ করেন।
